Iranian Chemist شیمیدان ایرانی
نرم افزار شبیه سازی مولکولی MacroModel
نرم افزار شیمی ماکرومدل یک نرم افزار مکانیک مولکولی قوی است. رابط گرافیکی با فایل ورودی از نوع ASCII میتواند استفاده شود. آنالیز تعداد زیادی ساختار در مسیرهای شبیه سازی شده مونت کارلو و یا دینامیکی میسر است. میدانهای نیروی در دسترس از نوع MM2، MM3، AMBER، OPLSA، AMBER94 و MMFF هستند.
میدان نیروی MM2 برای انواع ساختار حدواسط تعریف شده است.
بهینه سازی مکانیک مولکولی، شبیه سازی مونت کارلو و شبیه سازی دینامیک مولکولی را انجام میدهد.
مدل حلالپوشی GB/SA در دسترس است. برای ترکیبات پپتیدی، نوکلئوتیدها و کربوهیدراتها قابل استفاده است.
