بایگانی/آرشیو برچسب ها : شبیه سازی پروتئینها

تینکر مجموعه ای از برنامه ها برای اجرای محاسبات مکانیک مولکولی و دینامیک مولکولی است. تمام فایلهای ورودی آن از نوع ASCII است. نیاز به رابط گرافیکی ندارد ولی میتواند با رابطهای گرافیکی همچون RasMol، ChemDraw، Chem3D، MOLDEN و ReView مورد استفاده قرار میگیرد. همچنین این نرم افزار شامل بانک …

Molecular Operating Environment (MOE) software بسته نرم افزاری شامل مکانیک مولکولی، دینامیک، شرایط مرزی متناوب، QSAR، سازنده ساختارهای ترکیبی و مدلسازی پروتئینها و پلیمرها میباشد. خواصی همچون LogP و ضریب شکست مولی را محاسبه میکند. دارای رابط گرافیکی است. میدانهای نیروی در دسترس آن عبارتند از: AMBER89، AMBER94، MMFF94 و …