انجام پروژه های داکینگ مولکولی و غربالگری داروها

انجام پروژه های داکینگ مولکولی و غربالگری داروها

 

در سالهای اخیر، چاپ مقاله در ژورنال های معتبر شیمی به خاطر دلایل مختلفی بسیار سخت شده است. یکی از این دلایل که بایستی مولکول ها و مشتقات زیادی را سنتز کرده و تمامی آنالیزها را انجام داد تا بتوان امیدی به چاپ مقاله داشت. به خاطر شرایط مالی دانشگاه ها، اغلب اوقات انجام چنین پروژه هایی غیر ممکن است. به همین خاطر محققین سعی می کنند که با اضافه کردن داده های محاسباتی باعث قوی تر شدن مقاله و موجب چاپ شدن آن شوند.

از طرف دیگر، ژورنال ها نیز در سال های اخیر رغبت زیادی به چاپ مقالات عملی محاسباتی پیدا کرده اند. طراحی دارو، مجموعه ای از محاسبات مولکولی است که در راستای تقویت علمی کارهای حوزه دارو انجام می گیرد. بخشی از محاسبات طراحی دارو مربوط به محاسبات داکینگ مولکولی می باشد.

داکینگ مولکولی در حقیقت بررسی نحوه جایگیری مولکول دارویی در سایت فعال بیومولکول ها (رسپتور، آنزیم و دیگر انواع پروتئین ها) و همین طور میزان برهمکنش آنهاست.

 

 

اطلاعات قابل استخراج از داکینگ مولکولی

• استخراج ساختار بیومولکول ها
• استخراج یا بهینه سازی ساختار داروها
• بهینه سازی ساختار بیومولکول ها
• جایگیری مولکول های آب و کوفاکتورهای لازم در بیومولکول ها
• برهم کنش داروها با بیومولکول ها
• آنالیز برهم کنش لیگاند – رسپتور
• بررسی انرژی بر هم کنش های بین مولکولی
• بررسی انرژی بر هم کنش های درون مولکولی
• بررسی انرژی های الکتروستاتیک
• بررسی انرژی پیوند هیدروژنی
• بررسی انرژی های فضایی
• تعیین آمینواسیدهای درگیر و میزان شدت برهم کنش آنها
• غربالگری ساختار داروها
• استخراج برهم کنش دو بعدی دارو با بیومولکول
• استخراج برهم کنش سه بعدی دارو با بیومولکول

 

 

انجام پروژه های داکینگ مولکولی، غربالگری داروها و طراحی دارو توسط دکتر مهدی نباتی

شماره واتساپ: ۰۹۰۱۱۸۲۸۱۴۰

پیج اینستاگرام: ir_chemist

 

 

 

 

وبسایت شیمیدان ایرانی