مکانیک کوانتومی توصیف ریاضی صحیح از رفتار الکترونها و در نهایت توصیف شیمی با استفاده از ریاضی است. از دیدگاه نظری، مکانیک کوانتومی میتواند هر خاصیتی از یک اتم یا مولکول مجزا را به طور دقیق، فقط برای سیستمهای تک الکترونی حل شده اند. روشهای زیادی برای حل تقریبی سیستمهای …
بیشتر بخوانید »آشنایی کلی با کاربردهای نرم افزار شیمی محاسباتی ADF
این نرم افزار به عنوان محاسبات از نوع تابعیت چگالی آمستردام (Amesterdam density functional) میباشد. این برنامه یک برنامه DFT با چندین سیمای قابل توجه دارد که میتوان به استفاده از مجموعه پایه STO و توانایی اجرای محاسبات DFT اشاره نمود. هر دو تابعیتهای LDA و گرادیان اصلاح شده را …
بیشتر بخوانید »مروری بر کاربردهای نرم افزار شیمی آلی محاسباتی اسپارتان (Spartan)
اسپارتان یک کد کامپیوتری برای اجرای محاسبات آغازین، DFT، نیمه تجربی و مکانیک مولکولی است که به راحتی با یک رابط گرافیکی استفاده میشود. این برنامه برای هر دو گروه شیمیدانان تجربی و موسسه های آموزشی مطلوب میباشد. این برنامه قابلیتهای زیر را دارد: به راحتی حالات واسطه، جستجوهای کنفورماسیونی، …
بیشتر بخوانید »هایپرکم (HyperChem) نرم افزاری قدرتمند برای مدلسازی مولکولی
یک رابط گرافیکی، محاسباتی و بسته نرم افزار تجسمی است. قادر به محاسبات آغازین، نیمه تجربی و مکانیک مولکولی است. توانایی محاسبه فرکانسهای ارتعاشی، حالات واسطه، حالات تحریک، محاسبات QM/MM، دینامیک مولکولی و شبیه سازی مونت کارلو را دارد. قادر به نمایش های شیوه های ارتعاشی و تجسم سطح مولکولی …
بیشتر بخوانید »آشنایی با نرم افزار شیمی محاسباتی ACD ChemSketch
یک رابط گرافیکی با نام جدید chemsketch برای رسم دو بعدی ساختار مولکول است که بیشتر برای رسم ساختار پروتئینها استفاده میشود. قابلیت بهینه سازی ساختار هندسی سه بعدی مولکول بر اساس میدان نیرو از نوع CHARMM است. قادر به تولید فایلهای ورودی و خروجی با فرمت HTML یا VRML …
بیشتر بخوانید »معرفی نرم افزار مدلسازی مولکولی Chem3D
نرم افزار مدلسازی مولکولی برای استفاده در PC و سیستمهای مکینتاژ میباشد. محاسبات با استفاده از روش MM2 و هوکل توسعه یافته بوده و به راحتی به عنوان رابط بین نرم افزارهای MOPAC و Gaussian عمل می نماید. تواناییهای این نرم افزار به شرح زیر است: خواندن فایلهای ساختار شیمیایی …
بیشتر بخوانید »ترمودینامیک؛ سومین اصل بنیادین در شیمی محاسباتی
ترمودینامیک که برخی از مفاهیم انرژی، انرژی آزاد و آنتروپی را پوشش میدهد، موضوعی نیست که نیاز چندانی به کار تحقیقاتی مبسوطی داشته باشد. علت آن را میتوان دو مورد دانست: کامل بودن یا موجود بودن کارهای قبلی در این زمینه و عدم توانایی در فراهم کردن بینش مفصل از …
بیشتر بخوانید »الکتروستاتیک؛ دومین اصل بنیادین در شیمی محاسباتی
الکترواستاتیک، مطالعه برهمکنشها بین اجسام باردار است. الکترواستاتیک فقط سیستم مولکولی را تشریح نمیکند، بلکه برای درک برهمکنشهای الکترونها که با تابع موج یا چگالی الکترونی تشریح میشوند بسیار مهم است. ستون مرکزی الکتروستاتیک، قانون کولن است. دیگر تابع بسیار مفید در الکتروستاتیک، پتانسیل الکتروستاتیک است که تابعی تعریف شده …
بیشتر بخوانید »انرژی؛ اولین اصل بنیادین در شیمی محاسباتی
انرژی یکی از مفیدترین مفاهیم در علم است. تحلیل انرژی پدیده ها میتواند فرایندهای مولکولی را پیش بینی کند. در تمام روشهای شیمی محاسباتی، انرژی به گونه ای تعریف میشود که سیستم با کمترین انرژی، پایدارترین سیستم است. بنابراین یافتن شکل یک مولکول، متناظر با یافتن آرایشی از آن با …
بیشتر بخوانید »تدریس خصوصی شیمی آلی | شیمی عمومی | شیمی دارویی | تدریس شیمی آلی داروسازی
تدریس خصوصی شیمی آلی، شیمی دارویی و شیمی عمومی تدریس آنلاین (همه شهرها) و تدریس حضوری (فقط تهران) تدریس تمامی مباحث به صورت مفهومی بوده و به دور از فرایند حفظ کردن میباشد. فهرست دروس و مباحثی که توسط استاد تدریس میشود به شرح زیر میباشد: شیمی …
بیشتر بخوانید »