یک بسته نرم افزار نیمه تجربی است که بیشترین مصرف کننده را دارد. رابط گرافیکی آن اکثر نرم افزارهای گرافیکی است که میتوان به Chem3D، Hyperchem و Hypercube اشاره نمود. نسخه های مختلف آن در بازار موجود است. فایل ورودی آن از نوع ASCII و شامل ساختار مولکولی به فرم …
Read More »آشنایی با نرم افزار شیمی محاسباتی نیمه تجربی AMPAC
سه برنامه نیمه تجربی شامل AMPAC، MOPAC و AMSOL از کد منبع مشابهی مشاق شده اند. دارای فایلهای ورودی و خروجی مشابه بوده ولی برای اهداف متفاوتی توسعه یافته اند. برنامه AMSOL شامل روشهایی است که بیشتر برای اثرات حلال منظور شده است. AMPAC برای شناسایی ساختارهای حدواسط، کارآمد شده …
Read More »آشنایی با قابلیتهای نرم افزار شیمی محاسباتی Q-Chem
این برنامه انجام محاسبات آغازین با بهره وری بالا برای مولکولهای بزرگ را فراهم میکند. فایل ورودی و خروجی آن از نوع ASCII است. این برنامه میتواند با برنامه هایی نظیر HyperChem، Hypercube و UniChem به عنوان برنامه های رابط مورد استفاده قرار گیرد. محاسبات در دسترس عبارتند از: HF، …
Read More »آشنایی با نرم افزار شیمی محاسباتی گمس (Gamess)
گمس یک برنامه برای محاسبات آغازین و نیمه تجربی است که جنبه آغازین آن گسترش بیشتری یافته است. فایل ورودی این نرم افزار از نوع ASCII است و به قالبهای دیگر نیز قابل استفاده است. محققان مراکز آموزشی و علمی از آن بیشتر استفاده میکنند. روشهای آغازین در دسترس عبارتند …
Read More »آشنایی با نرم افزار شیمی محاسباتی کریستال (Crystal)
کریستال؛ یک برنامه برای محاسبات مولکولی از نوع آغازین و ساختار نواری (Band Structure) است (یعنی نواحی ای از انرژی الکترون میتواند دارا باشد و یا نواحی ای از انرژی که الکترون مجاز به دارا بودن آن نیست. بین این دو پهنا فاصله ای وجود دارد که به فاصله نوار …
Read More »آشنایی با نرم افزار شیمی محاسباتی ACD ChemSketch
یک رابط گرافیکی با نام جدید chemsketch برای رسم دو بعدی ساختار مولکول است که بیشتر برای رسم ساختار پروتئینها استفاده میشود. قابلیت بهینه سازی ساختار هندسی سه بعدی مولکول بر اساس میدان نیرو از نوع CHARMM است. قادر به تولید فایلهای ورودی و خروجی با فرمت HTML یا VRML …
Read More »